Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

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Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Kcnma1Q08460 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Kcnma1Q08460 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Kcnma1Q08460 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Kcnma1Q08460 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Kcnma1Q08460 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Kcnma1Q08460 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Kcnma1Q08460 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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