Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
AmbpQ07456 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms