Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Cdx4Q07424 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms