Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sh3bp2Q06649 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
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Sh3bp2Q06649 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms