Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scg2Q03517 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scg2Q03517 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
Scg2Q03517 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg2Q03517 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scg2Q03517 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg2Q03517 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scg2Q03517 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg2Q03517 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg2Q03517 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Scg2Q03517 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scg2Q03517 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scg2Q03517 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scg2Q03517 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms