Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacna1sQ02789 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cacna1sQ02789 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms