Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EgfrQ01279 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EgfrQ01279 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms