Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gjb2Q00977 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms