Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SeleQ00690 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms