Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited1P97769 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Cited1P97769 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Cited1P97769 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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