Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nbr1P97432 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 678.8 ms