Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psme1P97371 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms