Protein–RNA interactions for Protein: P97370

Atp1b3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b3P97370 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp1b3P97370 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp1b3P97370 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms