Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arf1P84078 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arf1P84078 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arf1P84078 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arf1P84078 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms