Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ptprn2P80560 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms