Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Chl1P70232 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chl1P70232 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chl1P70232 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Chl1P70232 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms