Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Rpl39P62892 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms