Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Usp46P62069 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms