Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Lmo4P61969 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Lmo4P61969 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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