Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ppfia3P60469 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms