Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CgnP59242 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CgnP59242 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CgnP59242 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CgnP59242 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CgnP59242 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CgnP59242 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms