Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Cldn18P56857 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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