Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
TspoP50637 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
TspoP50637 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
TspoP50637 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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