Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hcls1P49710 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hcls1P49710 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hcls1P49710 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hcls1P49710 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Hcls1P49710 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hcls1P49710 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hcls1P49710 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Hcls1P49710 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hcls1P49710 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hcls1P49710 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hcls1P49710 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hcls1P49710 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hcls1P49710 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hcls1P49710 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hcls1P49710 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hcls1P49710 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Hcls1P49710 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms