Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gli1P47806 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gli1P47806 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gli1P47806 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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