Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SrprbP47758 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SrprbP47758 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SrprbP47758 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms