Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
PpargP37238 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms