Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PtprkP35822 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtprkP35822 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtprkP35822 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
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