Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Usp4P35123 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Usp4P35123 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms