Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ptk2P34152 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms