Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Rom1P32958 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rom1P32958 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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