Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Pabpc1P29341 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Pabpc1P29341 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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