Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprmP28828 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PtprmP28828 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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