Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atxn10P28658 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atxn10P28658 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms