Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gjb1P28230 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gjb1P28230 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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