Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Psmb9P28076 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Psmb9P28076 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms