Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PdgfraP26618 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PdgfraP26618 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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