Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Eif3aP23116 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Eif3aP23116 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms