Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
VimP20152 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
VimP20152 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
VimP20152 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
VimP20152 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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