Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PdgfaP20033 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms