Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
P18528 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
P18528 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
P18528 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms