Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PtpraP18052 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PtpraP18052 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms