Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gata1P17679 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Gata1P17679 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gata1P17679 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms