Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou4f1P17208 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms