Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb1P13372 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms