Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Prf1P10820 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Prf1P10820 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms