Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxd4P10628 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms