Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
P10404 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
P10404 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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P10404 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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P10404 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
P10404 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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