Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccl20O89093 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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Ccl20O89093 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ccl20O89093 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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