Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Stra6O70491 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Stra6O70491 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Stra6O70491 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Stra6O70491 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Stra6O70491 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Stra6O70491 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Stra6O70491 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Stra6O70491 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Stra6O70491 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Stra6O70491 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stra6O70491 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Stra6O70491 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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